Las calles empedradas de Villa de Leyva nos llevan a visitar los diferentes sitios de interés dentro del pueblo. Encontramos la “Real fábrica de Licores”, una de las primeras fábricas de licores en el país. Podemos visitar en Villa de Leyva las casas de los personajes ilustres que nacieron en la Villa, como el general Gustavo Rojas Pinilla, Antonio Ricaurte (el héroe de San Mateo en honor de quien se ha erigido el Museo Militar), Vargas Tejada el dramaturgo.  

La zona de Villa de Leyva también sirvió como escenario para levantar edificaciones dedicadas a ser conventos, como el Convento de San Agustín (hoy funciona allí el instituto Humboldt); el convento de Las Carmelitas Descalzas que viven en clausura dedicadas a la oración y a las manualidades; El convento del Santo Ecce Homo  fundado por los Padres Dominicos; El convento de La Candelaria fundado en 1604. 

Villa de Leyva es un área geográfica de gran interés por su historia geológica y paleontológica evidenciada en yacimientos de rocas marinas del Cretácico, con alto contenido de fósiles; para su estudio y exhibición al público la Universidad Nacional ha organizado el Museo Paleontológico. 

Además de los paisajes boyacenses que se puede apreciar en Villa de Leyva, existe el santuario de Flora y Fauna de Iguaque, cuna de la humanidad según las creencias Muiscas.  

Otros sitios de interés como el Infiernito, el Cárcamo, y el Paso del Ángel pueden ser visitados a las afueras de Villa de Leyva.